南昌市医疗器械公司注册流程如下：1、仓库面积大于15㎡，办公室面积大于30㎡，并按照药监局的要求布局；2、带上名称预先核准申请书；投资人身份证明；注册资金、出资比例到工商查名；3、带上相关材料办理《受理通知书》和《医疗器械经营企业许可证》；4、到工商局注册。
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这里有一个问题，那就是如果公司不涉及到储存或者全部的储存交由其它的医疗器械经营企业进行储存的话，可以不设立库房。库房的面积是有要求的，一般南昌市医疗器械公司申请条件要求库房的场地面积不能够低于四十平方米。除了库房面积有要求之外，库房还需要建立一套类似于进销存的系统，能够很好地跟踪每一个批次的医疗器械的去向。在南昌市医疗器械公司注册的时候，质监部门的检查人员会考核员工对于系统的熟悉程度。现在这套系统有很多几个厂商能够提供，申请材料里面还需要提供这个系统的功能等相关说明。
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有下列经营行为之一的，企业可以不单独设立医疗器械库房：（一）全部委托为其他医疗器械生产经营企业提供贮存、配送服务的医疗器械经营企业进行存储的，（二）专营医疗器械软件或者医用磁共振、医用X射线、医用高能射线、医用核素设备等大型医用设备的；（三）省级食品药品监督管理部门规定的其他可以不单独设立医疗器械库房的情形。
申请医疗器械备案凭证的具体程序:
1、到工商行政管理部门办理营业执照，注册为企业，个体工商户不得办理备案凭证。
2.到质监局办理组织机构代码证。
3.在国家食品药品监督管理局网站上使用组织机构代码注册账户，在线申报。
4.在线提交《医疗器械备案申请表》所需的电子资料。
办理三种医疗器械经营许可证的程序如下：
1.准备必要的处理资料:
(1)《医疗器械经营许可证申请表》；
(2)资格证书；
(3)营业执照或企业名称预先核准证书复印件；
(4)质量管理人员证书；
(5)售后服务人员资格证书。
2.需要办理许可证的企业经营者携带上述材料到当地市级人民政府食品监督管理部门申请营业执照；
3.管理部门受理资料，30个工作日内审核，必要时组织审核；
4.符合条件的，管理部门发行医疗器械经验许可证，不符合条件的，管理部门不予许可，书面说明理由。
南昌市隐形眼镜在经营中，要办理医疗器械经营许可证需要满足的条件：
1.具有与经营范围和经营规模相适应的质量管理机构或者质量管理人员，质量管理人员应当具有国家认可的相关或者职称；（要求：必须 械大专以上学历3年以上经验，2人以上）；
2.具有与经营范围和经营规模相适应的经营、贮存场所；（要求：经营场地面积需与经营产品和经营方式及法律法规相符合）；
3.具有与经营范围和经营规模相适应的贮存条件、设施设备等；（要求：经营设施设备需与经营产品及经营方式及法律法规相符合）；
4.具有与经营的医疗器械相适应的质量管理制度；（要求：经营管理制度需与经营方式及经营产品及法律法规相符合）；
5.具备与经营的医疗器械相适应的、技术培训和售后服务的能力。 以上需内容需现场文件核查及现场核查。
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