医疗器械经营许可证办理流程（新办）：公司筹备（包括股东确定、经营场地选择、人员招聘、公司制度制定）；公司注册（取得营业执照及其公章和公司账户建立）；然后许可证办理（包括经营备案、经营许可、网络销售资格办理）等三部。值得注意的是公司筹备过程中应首先确定办理医疗器械经营许可证所需条件（如人员、场地要求等）。
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医疗器械经营登记证和医疗器械经营许可证的处理条件不同:国家药品监督管理局要求，申请第三类医疗器械经营许可证的企业必须使用符合医疗器械经营质量管理标准的GSP软件；对于申请第二类医疗器械经营备案证的企业，国家药品监督管理局建议使用GSP软件，但不是强制性要求。从提交的信息来看，申请第三类医疗器械经营许可证提交的信息需要包括计算机信息管理系统的基本信息介绍和功能描述，而不需要获得第二类医疗器械经营备案凭证提交的信息。
一、医疗器械公司注册所需材料
1、名称与经营范围,注册资本及股东出资比例,股东等身份证明;
2、医疗器械产品注册证书、生产许可证、营业执照及授权书;
3、质量管理文件等;
4、3个以上医学或相关人员证书、身份证明与简历; -
二、医疗器械公司注册流程
1、到工商局办理《名称预先核准通知书》;
2、开设验资帐户,股东出资,会计师事务所出具验资报告;
3、办理营业执照
4、刻章;
5、办理组织机构代码证;
6、办理税务登记证;
7、当地食品药品监督管理局网站上提交网上申请材料;
8、网上材料审核通过后,药监局预约并察看经营场地;
9、提交书面申请材料，审核通过后颁发《医疗器械经营许可证》
销售销售三类医疗器械需要具备一定面积的场地。具体要求如下：
一、经营6840 临床检验分析仪器及诊断试剂(含诊断试剂)：(1) 经营场所：100平方米；(2)库房：60平方米；(3)冷库：20立方米；
二、经营6821医用电子仪器设备、6846植入材料人工器官、6863口腔科材料、6877介入器材产品的： (1)经营场所：100平方米；(2)库房：40平方米
三、经营6815注射穿刺器械、6845体外循环及血液处理设备、6864医用卫生材料及敷料、6865医用合材料及粘合剂、6866医用高 分子材料及制品的： (1)经营场所：60平方米；(2)库房：80平方米
四、经营6822医用光学器具、仪器及内窥镜设备(软性角膜接触镜)类零售业务的，应设有独立的柜台，其中提供验配服务的，经营场所：30平方米，验光室(区)应具备暗室条件或满足无直射照明的条件。
五、经营其他三类医疗器械的，经营场所：60平方米，并配备与经营规模相适应的仓库。
六、符合下列情况之一的，经营企业可以不单独设立库房，但贮存环境应当满足医疗器械标签、说明书标注的条件要求：
(1)仅从事医疗器械零售业务的；
(2)全部委托其他经营企业贮存、配送的；
(3)专营医疗器械软件或医用磁共振、医用X射线、医用高能射线、医用核素设备等大型医疗器械设备的 一二三类医疗器械。
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